Ответ: Существует публичное хранилище плагинов для продуктов Atlassian - оно называется Atlassian Plugin Exchange: https://plugins.atlassian.com/plugin/home.
Установить плагин можно следующими способами:
1. Скачать плагин с Atlassian Plugin Exchange (обычно в виде установочного JAR-файла). Скопировать файл в одну из папок (будет указан в описании плагина):
после чего перезапустить сервис JIRA.
2. Воспользоваться утилитой Universal Plugin Manager, которая автоматически устанавливает плагины. Его можно так же установить из Atlassian Plugin Exchange.